有一天，米奇家莫明其妙地發(fā)生了一件突發(fā)案件——米奇的朋友米妮被人綁架了。米奇立刻打電話給名偵探柯南，柯南聯(lián)系了黑貓警長，一起來到了案發(fā)現(xiàn)場調(diào)查。

名偵探柯南和黑貓警長一來到案發(fā)現(xiàn)場，只見米奇正坐在地上哭哭啼啼，在門口還有兩行神秘的腳印。黑貓警長問米奇：“這一天都有誰來過你家？”米奇忍住悲憤回憶了下，認(rèn)真地回答道：“早上，米妮到我家來玩。接著，唐老鴨、斑點(diǎn)狗和牛大伯也來到了我家拜訪，然后就回去了。我和米妮一直玩到晚上，突然，不知是停電還是被人切斷了電源，家里的燈都熄滅了，我剛要去點(diǎn)蠟燭，就在這時，門突然被打開，我嚇得趕緊躲到了沙發(fā)的后面，米妮卻嚇傻了，呆在原地一動也不動。接著，一個黑色人影走了進(jìn)來，他長得又高又胖 …… 最后就把米妮給綁走了。”說完，米奇又哭了起來。柯南聽完后，找起了蛛絲馬跡，黑貓警長拿出通話器，命令白貓干警立即挑選出優(yōu)秀的白貓隊(duì)員來到現(xiàn)場，準(zhǔn)備作戰(zhàn)。

名偵探柯南找了一會兒，除了那些可疑的腳印，沒有發(fā)現(xiàn)任何可疑的東西。柯南立刻拿出神奇寶貝球，召喚出妙蛙種子和菊草葉，讓它們在房子的每個地方聞一聞，有沒有可疑的氣味，又召喚出噴火龍和鴨嘴火龍，讓它們往上方噴出小火，為房子照明。這時，白貓部隊(duì)趕到了，黑貓警長命令白貓隊(duì)員們立刻在房子外圍找一找有什么可疑的東西和可疑的人。

過了一會兒，白貓部隊(duì)雖然沒有找到什么可疑的東西，但是他帶來了三位嫌疑人，他們就是米奇的鄰居唐老鴨、斑點(diǎn)狗和牛大伯，經(jīng)過仔細(xì)的調(diào)查和審問，他們?nèi)齻€都不是兇手，那誰才是真正的兇手呢？

正在大家一籌莫展的時候，黑貓警長想到了一個好主意，立即打電話到“快樂星球”，接電話的是艾克，黑貓警長連忙請艾克把他的“萬能手表”帶來用一下。

不一會兒，艾克也來到了案發(fā)現(xiàn)場，把“萬能手表”對準(zhǔn)可疑腳印按了追蹤系統(tǒng)，“萬能手表”在一瞬間變成了“電子警犬”，照著兇手留下的氣味一路追蹤了過去，大家都隨著警犬一齊前進(jìn)。不一會兒，他們來到了一個小屋外，黑貓警長命令白貓隊(duì)員立刻包圍這間小屋，進(jìn)行地毯式搜索。

過了不久，白貓隊(duì)員帶出來了兩個人，一個是米妮，另一個就是那個神秘人了，他又高又胖，和米奇所形容的一模一樣。米奇一見到了米妮便激動地?fù)肀Я松先ィ睦锏囊粔K大石頭終于落地了。

經(jīng)過嚴(yán)厲地審問，知道了那個綁架米妮的人就是三年前無惡不作的黑狗集團(tuán)中的老大，他原來是想綁架米妮來控制米妮當(dāng)科學(xué)家的父母，為他們制造武器。經(jīng)過大家的努力，黑狗集團(tuán)的所有人都被抓住了，也破滅了他們的大陰謀。

為了慶祝這次勝利，米奇邀請了名偵探柯南、黑貓警長和艾克等人來到米奇妙妙屋去作客。大家都沉浸在歡樂的氣氛中。